Phòng thí nghiệm Vi sinh (Laboratory of Micro-organism) phục vụ việc giảng dạy, học tập và nghiên cứu khoa học của giảng viên và sinh viên Khoa Kỹ thuật Hóa học và Mội trường, ngoài ra phòng còn phục vụ các đề tài nghiên cứu khoa học và chuyển giao công nghệ của Khoa và nhà trường. Phòng Thí nghiệm Vi sinh được trang bị đầy đủ các trang thiết bị hỗ trợ sinh viên thực hiện các thí nghiệm vi sinh, thí nghiệm kỹ thuật trồng nấm và thí nghiệm công nghệ lên men.